システムの復元でFMSのインストール前に戻ったのですから、
FMSが正常起動しないのはあたりまえですよ。(^_^;)
それはそうと、一連の不具合をいったん整理させてください。
結局のところ、グラフィックボードをNVIDIA GeForce9800GTX+から
NVIDIA GeForce450GTSに入れ替えてからFMSの表示が変になったんですよね。
そうなるとグラフィックボードのドライバーが
正常にインストールされていないと思います。
おそらく、ほぼ間違いないでしょう。
GeForce450GTSのドライバーを正しくインストールしなおしてください。
そのGeForce450GTS自体がFMSのような古いゲームに
対応していない可能性もあるかもしれませんが・・・。